Su bazlı kaplamalar, inşaat sürecinin ve malzeme yüzeyinin temizliği konusunda yüksek gereksinimlere sahiptir. Suyun büyük yüzey gerilimi nedeniyle, kirin kaplama filminde büzülme deliklerine neden olması muhtemeldir. .
Su bazlı kaplamalar, kaplama ekipmanı için oldukça aşındırıcıdır ve korozyon önleyici astarların veya paslanmaz çelik malzemelerin kullanılmasını gerektirir, bu da yüksek ekipman maliyetlerine neden olur.
Pişirme suyu bazlı kaplamalar, inşaat çevre koşulları (sıcaklık, nem) konusunda daha katı gereksinimlere sahiptir.
Su bazlı boya suyunun gizli buharlaşma ısısı büyüktür ve pişirme enerji tüketimi büyüktür.
Su bazlı boyanın zayıf su direnci sorunu vardır, bu da boyanın ve banyo sıvısının stabilitesini zayıflatır ve kaplama filminin su direnci zayıftır.